nature-skills 面向全球 AI 学者收录可复用科研技能，强调真实问题解决、可验证工作流与可直接使用的科研产物。
大家好，我是 nature-skills 的创立者袁一哲。感谢大家持续关注本项目。我们在抖音更新了许多视频教程，大家可以根据名称检索查看，希望能够真正帮助到科研工作。
知识星球名称：Nature Skills 以及背后的哲学。
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| 开发者 | 项目角色 | 主要方向与贡献 | 主页与联系 |
|---|---|---|---|
| 袁一哲 | 创始人 / 维护者 | 项目发起、技能体系设计与社区运营 | — |
| 马昕瑞 | 核心开发者 | Skills 日常维护 | Gmail |
| 胡彬 | 主要贡献者 | Agentic Agent | GitHub · Email |
- 最近发现，我设计的 Nature Skills 被谷歌 DeepMind 关注并借鉴，他们参考了其中的引用体系、脚本思路以及技能设计哲学，推出了 Science Skills。说实话，这让我挺欣慰的——当国外的顶尖 AI 机构开始从我们的工作中汲取灵感时，说明中国开发者的原创思想正在被世界看见。这不是被复制的失落，而是中国力量在开源土壤里生根后，自然向外生长出的影响力。
- 我们设计 Skills 的重心，从来不是要求每个人都来啃透这套思想，而是这套思想本身就具备被机器理解并复用的能力。你如果想创立一个全新的 Skill，或者把它适配到自己的专属领域，根本不需要从头学起——直接把 Nature Skills 的 GitHub 地址发给 Codex，它就能自动学习其中的设计精髓，帮你完成新 Skill 的创建和修改。这才是思想的真正解放：它不再依赖口口相传，而是通过 AI 直接流淌进每一个需要它的角落。
- Nature Skills 真正的价值，或许并不在于那些具体的技能模块，而在于它悄悄推开了一扇新的大门——它让很多人第一次意识到，原来可以借助 Codex 或智能体来操控本地电脑做科研。我有幸见证并陪伴了许多人完成科研范式的转变。当他们惊叹“原来科研还可以这样去做”的那一刻，这种认知上的破壁和解放，远比 Skills 本身更让我觉得有意义。它不是一个工具的成功，而是一种新的思考方式开始在人群中蔓延。
- 在当下，几乎所有实用的工具都可以被提炼为标准化流程，而标准化流程恰好可以封装成可复用技能。
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安装完成后，可以直接把论文、段落、审稿意见或任务描述交给 Agent。下面这些提示词可以直接复制使用：
| 想做什么 | 直接这样说 |
|---|---|
| 读论文 / 中英文对照 | 把这篇 PDF 做成图文对应的中英文对照 Markdown reader。 |
| 生成文献汇报 PPT | 把这篇论文做成中文组会汇报 PPT，保留关键图件和来源标注。 |
| 润色或翻译论文段落 | 把这段中文改写成 Nature 风格英文，保持学术含义不变。 |
| 写摘要、引言或讨论 | 根据这些结果和图件，帮我起草 Nature 风格的摘要和引言。 |
| 预投稿审稿模拟 | 从 Nature 审稿人视角评估这篇稿件，给出三份 reviewer reports。 |
| 回复审稿意见 | 根据这封返修邮件，帮我写逐点回复、cover letter，并标出修改稿需要标红的位置。 |
| 查文献、他引和引用者画像 | 整理这篇文章的引用数、严格他引数、DOI，并看引用者里有没有院士、Fellow 或领域大牛。 |
| 做科研图或论文示意图 | 根据这段方法和结果，帮我生成投稿级科研图或论文示意图草稿。 |
如果你不确定该用哪个技能，直接描述任务即可；如果已经知道技能名，可以在提示词中明确写“使用 nature-reader”或“使用 nature-response”。
nature-skills 是一组围绕 SKILL.md 组织的可复用技能包。skills/ 下的每个顶层技能目录都是一个可安装单元，例如 nature-*；nature-shared 是供其他技能读取的共享支持包，默认不作为独立触发技能计入技能索引。
需要先安装 Node.js 18 或更高版本。无需全局安装 CLI；先查看仓库中可安装的技能名：
npx skills add Yuan1z0825/nature-skills --list把全部技能全局安装到 Codex。nature-shared 会随全量安装一起加入，因此依赖共享参考资料的技能也能正常工作：
npx skills add Yuan1z0825/nature-skills --global --agent codex --skill '*' --yes --copy只为当前项目安装一个独立技能时，省略 --global。例如：
npx skills add Yuan1z0825/nature-skills --agent codex --skill nature-figure --yes --copy单独安装 nature-reader、nature-paper2ppt、nature-polishing 或 nature-writing 时，同时选择共享支持包：
npx skills add Yuan1z0825/nature-skills --global --agent codex \
--skill nature-reader --skill nature-shared --yes --copy也可以把全部技能安装到 CLI 支持的所有 agent：
npx skills add Yuan1z0825/nature-skills --all检查全局安装结果并更新：
npx skills list --global --agent codex --json
npx skills update --global --yes只更新一个技能，或只更新当前项目中的技能：
npx skills update nature-reader --global --yes
npx skills update --project --yes技能选择参数使用 --list 显示的 frontmatter 名称；例如目录 nature-proposal-writer 当前显示为 researchwrite。npx skills 管理的是技能文件，Python、R、浏览器或 MCP 等可选运行依赖仍需按下文说明单独配置。
Claude Code 不能直接使用 scripts/update-codex-skills.sh，因为这个脚本只负责同步到 Codex 的 ~/.codex/skills/。用于 Claude Code 时，推荐保留一个稳定的本地 clone，再用 subagent 或 slash command 指向真实的 skills/*/SKILL.md。这样不会破坏技能目录结构，也能继续读取 references/、static/、manifest.yaml、脚本、资产和 skills/nature-shared/。
如果还没有安装 Claude Code：
npm install -g @anthropic-ai/claude-code
claude先把仓库 clone 到一个稳定路径：
mkdir -p ~/ai-skills
cd ~/ai-skills
git clone https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills.git推荐方式：为常用技能创建 Claude Code subagent wrapper。以 nature-reader 为例：
mkdir -p ~/.claude/agents
cat > ~/.claude/agents/nature-reader.md <<'EOF'
---
name: nature-reader
description: Use for Chinese-English paper reading, figure-aware translation, and source-grounded paper notes.
---
When invoked, first read `~/ai-skills/nature-skills/skills/nature-reader/SKILL.md` and follow it as the governing workflow.
Read supporting files from `~/ai-skills/nature-skills/skills/nature-reader/` and `~/ai-skills/nature-skills/skills/nature-shared/` only when needed.
Do not replace this skill with a generic paper-reading response.
EOF然后开启新的 Claude Code 会话，直接请求使用这个 subagent：
Use the nature-reader subagent to turn this paper into a Chinese-English Markdown reader.
如果你更喜欢 slash command，也可以创建命令 wrapper：
mkdir -p ~/.claude/commands
cat > ~/.claude/commands/nature-reader.md <<'EOF'
Read `~/ai-skills/nature-skills/skills/nature-reader/SKILL.md` first and follow it strictly.
Read directly needed supporting files from `~/ai-skills/nature-skills/skills/nature-reader/` and `~/ai-skills/nature-skills/skills/nature-shared/`.
$ARGUMENTS
EOF在 Claude Code 中使用：
/nature-reader 把这篇论文做成中英文对照的完整 Markdown reader。
安装其他技能时，把示例中的 nature-reader 换成对应目录名即可，例如 nature-polishing、nature-writing、nature-reviewer、nature-response 或 nature-figure。后续更新只需要：
cd ~/ai-skills/nature-skills
git pull只要 wrapper 仍然指向这个稳定 clone 路径，就不需要重复复制技能文件。
自动更新（可选）
如果你希望 Claude Code 每次开启会话时自动拉取上游更新，可以用 scripts/autoupdate-skills.sh 配合一个 SessionStart 钩子。
这套方式把技能直接复制进 ~/.claude/skills/（Claude Code 会自动发现该目录，技能以目录名直接加载），而不是使用上面的 wrapper。两种方式二选一即可。
先保留一个专用的稳定 clone（只用于同步技能，请不要在里面做开发提交）：
mkdir -p ~/ai-skills
git clone https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills.git ~/ai-skills/nature-skills首次安装，把技能复制进 Claude Code 的技能目录：
~/ai-skills/nature-skills/scripts/autoupdate-skills.sh --force然后在 ~/.claude/settings.json 里加一个 SessionStart 钩子（若已有 hooks，把这一项合并进去，不要整体覆盖）：
{
"hooks": {
"SessionStart": [
{
"hooks": [
{
"type": "command",
"command": "$HOME/ai-skills/nature-skills/scripts/autoupdate-skills.sh",
"async": true,
"timeout": 120
}
]
}
]
}
}async: true 让它在后台运行、不阻塞启动。脚本自带保护：默认 6 小时内不重复联网检查、断网或拉取失败自动跳过（exit 0，绝不卡住会话）、只有上游 HEAD 真正变化时才重新同步、并且拒绝在有未提交改动的 clone 上强行前进。拉到的新版会在下一次开启会话时生效（当前会话的技能已经加载完毕）。运行日志在 ~/.local/state/nature-skills/autoupdate.log。
目标目录与检查频率都可配置：
# 默认同步到 ~/.claude/skills；用 --dest 指到别处，例如 Codex：
~/ai-skills/nature-skills/scripts/autoupdate-skills.sh --dest ~/.codex/skills
# 只在最多每小时检查一次：
~/ai-skills/nature-skills/scripts/autoupdate-skills.sh --throttle 3600推荐使用仓库自带脚本安装或更新 Codex skills。脚本会同步 skills/ 下所有顶层技能目录，并在复制后做 diff 验证；它不会覆盖其他无关 Codex skills。
git clone https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills.git
cd nature-skills
scripts/update-codex-skills.sh --pull如果已经 clone 过仓库：
cd nature-skills
scripts/update-codex-skills.sh --pull验证当前 Codex 安装是否和这个 checkout 一致：
scripts/update-codex-skills.sh --check如果你长期用这个脚本更新，并希望清理上游已经删除的旧技能目录：
scripts/update-codex-skills.sh --pull --prune--prune 只会删除以前由这个脚本记录过、但当前仓库已经不再包含的目录。第一次运行没有历史记录时，它不会猜测删除旧目录。
也可以把仓库链接交给 Codex，让 Codex 执行安装脚本。推荐提示词：
请从这个仓库安装 Codex skills：
https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills.git
请 clone 仓库后运行 scripts/update-codex-skills.sh --pull。
安装后再运行 scripts/update-codex-skills.sh --check 验证。
请保留 skills/ 下的完整技能目录，不要只复制 SKILL.md。
如果只安装单个技能，请明确说明技能名：
只安装这个仓库里的 nature-reader：
https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills.git
如果该技能需要共享文件，也请一并安装 skills/nature-shared。
关键规则：保留完整目录结构。请复制或引用整个技能文件夹，而不是只复制 SKILL.md，因为许多技能依赖 references/、static/、manifest.yaml、脚本、资产或共享文件。
安装脚本不会自动安装 Python 依赖。需要使用相关脚本或 MCP 服务时，再按需安装：
python -m pip install -r skills/nature-paper-to-patent/requirements.txt
python -m pip install -r skills/nature-paper-to-patent/scripts/disclosure/requirements-cnipa.txt # 可选：国知局公布公告检索
python -m pip install -r skills/nature-academic-search/mcp-server/requirements.txt如果启用 nature-paper-to-patent 的国知局公布公告检索，还需要执行 python -m playwright install chromium。
nature-academic-search 的 MCP 服务还需要单独配置 PUBMED_EMAIL，Scopus / ScienceDirect 等可选 provider 需要使用本机凭据配置，不要把 API key 写入仓库文件。
安装后，请开启一个新的 Codex 会话，然后自然描述任务，例如：
把这篇论文做成中英文对照的完整 Markdown reader。
把这篇论文做成中文PPT。
如果你使用 OpenClaw、OpenCode、Hermes 等开源 agent / 编程框架，请看 OpenClaw / OpenCode / Hermes 接入教程。
自动更新（可选）
Codex 支持全局 SessionStart hook。保留一个专用 clone 后，可以在每次启动或恢复 Codex 会话时检查更新，并把新版同步到 ~/.codex/skills/。
先创建专用 clone 并完成首次同步：
mkdir -p ~/.codex
git clone https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills.git ~/.codex/.nature-skills-src
~/.codex/.nature-skills-src/scripts/autoupdate-skills.sh \
--dest ~/.codex/skills --force然后创建或合并 ~/.codex/hooks.json：
{
"hooks": {
"SessionStart": [
{
"matcher": "startup|resume",
"hooks": [
{
"type": "command",
"command": "/bin/bash \"$HOME/.codex/.nature-skills-src/scripts/autoupdate-skills.sh\" --dest \"$HOME/.codex/skills\"",
"timeout": 75,
"statusMessage": "Checking Nature Skills updates"
}
]
}
]
}
}若 hooks.json 中已有其他 hook，请合并 SessionStart 项，不要整体覆盖。首次启用或修改 hook 后，在 Codex 中运行 /hooks 检查并信任它。Codex 当前按同步方式执行 command hook，因此这里依靠脚本自带的 6 小时节流、60 秒网络保护和断网自动跳过，避免每次会话都重复联网或因更新失败阻断启动。
更新日志位于 ~/.local/state/nature-skills/autoupdate.log。拉取到的新技能通常在下一次会话中完整生效。
OpenClaw、OpenCode、Hermes 的具体接入方式见 OpenClaw / OpenCode / Hermes 接入教程。
用于其他 agent 时，建议保留一个稳定的仓库 clone，再创建轻量 subagent、slash command 或 custom prompt wrapper，指向真实的 skills/*/SKILL.md，并保留 skills/nature-shared/。
手动或其他 agent 使用时：
- 将完整技能目录复制到你的 prompt library 或项目中。
- 保留
SKILL.md、manifest.yaml、static/、references/、脚本、资产和需要的skills/nature-shared/文件。 - 如目标 agent 有自己的格式要求，可调整 frontmatter 和正文结构。
当前 skills/ 下包含以下可触发技能；skills/nature-shared/ 是共享内容目录，不计入技能索引。点击技能名或“详情页”可以进入每个 skill 的单独说明页面。
| 技能 | 状态 | 用途 | 触发词 | 详情页 |
|---|---|---|---|---|
nature-figure |
Stable | 面向 Nature / 高影响力期刊的 Python 或 R 投稿级科研图工作流，内置 figures4papers demo，并支持通过 OpenRouter GPT Image 2 生成论文示意图草稿 | “Nature figure”, “投稿级图片”, “publication plot”, “scientific figure”, “figures4papers”, “论文示意图”, “GPT Image 2” | 详情 |
nature-polishing |
Stable | 将学术文本润色、重构或翻译为 Nature 风格英文 | “Nature style”, “润色”, “academic writing”, “论文英文” | 详情 |
nature-writing |
Draft | 起草 Nature 风格手稿章节，并重建论文论证 | “Nature writing”, “写摘要”, “写引言”, “manuscript draft”, “论文写作” | 详情 |
nature-reviewer |
Draft | 从审稿人视角模拟 Nature 风格评审，输出三份 reviewer reports 和综合意见 | “Nature reviewer”, “预投稿评审”, “reviewer report”, “审稿人视角评估” | 详情 |
nature-citation |
Beta | 检索严格限定在 Nature / CNS 系列的支撑文献，并导出 ENW、RIS 或 Zotero RDF | “Nature citation”, “CNS citation”, “分段引用”, “支撑文献”, “Zotero RDF” | 详情 |
nature-data |
Draft | 准备 Data Availability statement、数据仓储方案和 FAIR 检查 | “Data Availability”, “数据可用性”, “repository”, “FAIR metadata” | 详情 |
nature-statistics |
Draft | 审查、改写或起草 Nature / 高影响力期刊投稿中的统计报告，覆盖样本量、独立分析单位、重复数、p 值、多重比较、效应量、置信区间、图注统计和审稿人统计意见 | “Nature statistics”, “统计审查”, “statistical analysis”, “p value”, “sample size”, “replicates”, “multiple comparisons”, “图注统计”, “统计分析小节” | 详情 |
nature-reader |
Beta | 生成带来源锚点、图文对应和中英文对照的全文 Markdown reader | “nature reader”, “全文 Markdown”, “原文对照”, “图文对应”, “全文翻译” | 详情 |
nature-response |
Beta | 解析返修邮件，起草、审查和修改返修 cover letter、逐点回复审稿人的 response letter、标红修改稿，并提供 LaTeX 模板 | “response to reviewers”, “rebuttal letter”, “cover letter”, “major revision”, “返修邮件”, “审稿意见回复”, “修回信”, “LaTeX 模板” | 详情 |
nature-paper2ppt |
Beta | 从科研论文生成中文 PPTX 文献汇报 deck | “paper PPT”, “journal club”, “paper to slides”, “论文汇报” | 详情 |
nature-paper-to-patent |
Beta | 从论文、技术报告或项目材料生成有证据约束的中国发明专利草稿，并支持专利点挖掘、查新和技术交底书迭代 | “paper to patent”, “Chinese patent”, “论文转专利”, “权利要求书”, “技术交底书”, “专利点” | 详情 |
nature-ref-verifier |
Beta | 参考文献多源交叉验证：逐字段对比作者/标题/年份/卷期/页码，标记卷年冲突、作者编造、页码偏差等 | “verify refs”, “校验文献”, “check references”, “文献验证”, “ref check” | 详情 |
nature-academic-search |
Beta | 多源文献检索、引用核验、严格他引审计、文章引用指标表、高影响力引用者画像和参考文献管理 | “search papers”, “find articles”, “literature search”, “查文献”, “verify DOI”, “严格他引”, “文章引用表”, “引用我的文章的人有没有大牛” | 详情 |
nature-downloader |
Beta | 通过图书馆资源入口、Chrome 登录态和开放获取路径合法获取学术全文/PDF | “download papers”, “图书馆下载文献”, “CARSI”, “Web of Science”, “PDF 下载” | 详情 |
nature-literature-pipeline |
Stable | 自动化文献发现管线：多源检索、六维评分、精读推送和本地归档 | “literature pipeline”, “每日文献”, “文献推送”, “daily literature push”, “cron” | 详情 |
nature-experiment-log |
Draft | 标准化记录实验图片、语音和文字材料，生成带 YAML frontmatter 的 Obsidian 实验日志并归档原始材料 | “实验日志”, “记录实验”, “experiment log”, “Obsidian vault”, “飞书科研群” | 详情 |
nature-proposal-writer |
Beta | proposal-first 科研写作状态机，先建立证据、论证和章节契约，再起草或审查文本 | “researchwrite”, “proposal”, “开题报告”, “研究方案”, “科研写作 QA” | 详情 |
所有技能都遵守以下原则：
- 优先使用一手来源：规则基于已发表 Nature 内容、官方期刊指南或明确的本地来源，而不是泛泛审美偏好。
- 显式胜过隐式：每条规则都应说明理由，而不是只给断言。
- 感知章节与任务上下文：学术写作、图件、引用和回复都依赖上下文；不同论文部分使用不同逻辑。
- 输出优先：每个技能都应返回能直接使用的产物，例如可粘贴文本、
.svg、.pptx、.docx或具体建议。 - 可扩展：每个技能自包含在自己的目录中，新增技能不应要求修改既有技能。
skills/
├── nature-shared/ # 当技能引用 ../nature-shared 时需要保留
├── nature-<topic>/
│ ├── README.md
│ ├── README_EN.md
│ ├── SKILL.md
│ ├── manifest.yaml # router-style 技能会包含
│ ├── static/ # router-style 技能会包含
│ └── references/...
└── nature-proposal-writer/
├── README.md
├── README_EN.md
├── SKILL.md
├── scripts/...
├── templates/...
└── references/...
向本仓库添加技能时，请按以下流程：
1. 创建技能目录
skills/nature-<topic>/
2. 添加必需文件
| 文件 | 是否必需 | 用途 |
|---|---|---|
SKILL.md |
必需 | frontmatter（name、description）+ 规则 + 工作流；触发后由 agent 加载 |
README.md |
必需 | 面向人的中文说明文档 |
README_EN.md |
必需 | 与中文详情页配套的英文说明文档 |
references/*.md |
复杂技能推荐 | 模块化规则文件，例如 API、设计理论、教程、图表类型等 |
3. 编写中英文 README
每个新增技能都必须同时提供 README.md 和 README_EN.md。README 是面向人的技能入口页，不是 SKILL.md 的重复版，也不是安装手册。它的目标是让用户在 30 秒内判断：这个 skill 能不能解决我的问题、我要给它什么、它会产出什么、边界在哪里。
基本规则：
- 中文 README 和英文 README 必须一一镜像：标题数量一致、顺序一致、信息点一致；英文页不要写成另一套独立模板。
- 顶部固定为技能名、语言切换链接和一句定位说明。
- 默认使用下面的基础结构；只有确实需要时才插入可选章节。
- 不要在单个 skill README 中重复仓库安装教程、作者信息、变更日志、开发过程、完整文件树或大段内部实现细节。
- 复杂规则、API 参数、长教程、脚本说明和模板索引应放进
references/、static/、scripts/或SKILL.md，README 只保留路标。 - 如果技能有视觉资产，可以放一个小型预览表；不要把 README 变成大型图库或长篇技术手册。
中文 README 基础结构：
# `nature-<topic>` 技能
[English](README_EN.md)
一句话说明这个技能的定位、主要任务和使用边界。
## 适合用它做什么
## 典型请求
## 你需要提供
## 产出
## 边界
## 相关技能英文 README 必须对应为：
# `nature-<topic>` Skill
[中文说明](README.md)
One sentence describing the skill's role, main task, and usage boundary.
## What To Use It For
## Typical Requests
## What You Need To Provide
## Outputs
## Boundaries
## Related Skills可选章节必须中英文同步插入，并保持相同顺序。常见可选章节包括：
| 中文章节 | 英文章节 | 使用场景 |
|---|---|---|
## 工作方式 |
## Workflow |
需要解释核心流程或路由方式 |
## 运行和依赖 |
## Runtime and Dependencies |
有脚本、MCP、API key、本地配置或外部依赖 |
## 示例预览 |
## Example Preview |
有少量图件、截图或可视化资产值得展示 |
## 内置参考 |
## Built-In References |
需要指向 references/、assets/ 或 demo |
## 方法来源 |
## Method Sources |
写作、审查或分析规则来自特定来源 |
## 三种模式 |
## Three Modes |
技能有清晰的 compose/revise/hybrid 等模式 |
## 与 ... 的关系 |
## Relationship With ... |
容易和另一个技能混淆，需要说明分工 |
提交前至少做这些 README 检查：
python scripts/validate-readmes.py
git diff --check
for d in skills/nature-*; do
[ -f "$d/README.md" ] && [ -f "$d/README_EN.md" ] || continue
rg -q '^\[English\]\(README_EN\.md\)$' "$d/README.md"
rg -q '^\[中文说明\]\(README\.md\)$' "$d/README_EN.md"
test "$(rg -c '^## ' "$d/README.md")" = "$(rg -c '^## ' "$d/README_EN.md")"
done4. 录制使用教程
提交 PR 时，请同时录制一个简短的使用教程，说明这个 skill 解决什么问题、如何触发、需要什么输入，以及会产出什么结果。可以在 PR 描述中附上视频、录屏链接或可公开访问的教程地址。
5. 配置 SKILL.md frontmatter
---
name: nature-<topic>
description: >-
用一句话说明这个技能做什么、什么时候触发、主要输出格式和核心使用场景。
---6. 更新技能索引
在上方 技能索引 表格中添加一行：
| [`nature-<topic>`](skills/nature-<topic>/README.md) | Draft / Stable | 一句话用途 | 触发词 | [详情](skills/nature-<topic>/README.md) |7. 设置状态标签
| 标签 | 含义 |
|---|---|
Draft |
规则已定义，但尚未在真实案例上测试 |
Beta |
已在示例上测试，仍可能存在边界问题 |
Stable |
已在真实学术内容上验证，规则相对稳定 |
![@github-actions[bot]](https://avatars.githubusercontent.com/in/15368?s=64&v=4){kind=small}
